Сайт — https://colab.research.google.com
Сфера использования : Дизайн, Иллюстрация.
Цель : Создать 3D-объект.
Изменение : 3D в 3D.
3D биологический генератор — это нейросеть, используемая в биологических исследованиях для предсказания 3D-модели структуры белка. Эта нейросеть работает на основе искусственного интеллекта и использует упрощенную версию AlphaFold v2.3.2. В отличие от полной версии AlphaFold v2.3.2, в этом Colab-блокноте не используются шаблоны (гомологичные структуры) и лишь небольшая часть базы данных BFD. Эти изменения были проверены на нескольких тысячах недавних структур PDB. Хотя точность предсказания будет близка к полной системе AlphaFold на многих объектах, небольшая часть может иметь значительное снижение точности из-за меньшего MSA и отсутствия шаблонов. Для большей надежности рекомендуется использовать полностью открытый исходный код AlphaFold или базу данных структуры белка AlphaFold. Хотя этот Colab-блокнот имеет небольшое снижение средней точности для мультимеров по сравнению с локальной установкой AlphaFold, для полной точности мультимеров настоятельно рекомендуется запускать AlphaFold локально. Кроме того, AlphaFold-Multimer требует поиска MSA для каждой уникальной последовательности в комплексе, поэтому он заметно медленнее. Обращаем внимание, что этот Colab-блокнот предоставляется только для теоретического моделирования, и его использование требует осторожности.